Alle regionene er organisert i fem funksjoner: fastsetting, innkreving, kontroll og rettsanvendelse, skattekrim og veiledning.
Hver region består av flere fysiske kontorsteder kalt skattekontorer. Alle skattekontorene har en veiledningstjeneste som tar imot folks henvendelser på alle Skatteetatens oppgaveområder. I tilegg finnes Skatteopplysningen – etatens veiledningstjeneste på telefon.
Regionene og Skatteopplysningen er underlagt Skattedirektoratet, som står for den faglige, strategiske og administrative ledelsen av etaten.
Skatteetaten er som helhet underlagt Finansdepartementet. Basert på det lovverket Stortinget har vedtatt, trekker Finansdepartementet opp retningslinjer for Skatteetatens virksomhet.
Skattedirektoratet består av:
- Det strategiske direktoratet, som har den sentrale faglige og administrative ledelsen av Skatteetaten
- Skatteetatens IT - og servicepartner, som er Skatteetatens leverandør innenfor IT og administrative tjenester.
