Godkjenning av forskningsprosjekt etter FSFIN § 16‑40‑4 kan inndras av Norges Forskningsråd etter FSFIN § 16‑40‑10 annet ledd, dersom skattyter ikke oppfyller rapporteringsplikten etter FSFIN § 16‑40‑10 første ledd, eller innrapporterer uriktige eller mangelfulle opplysninger, jf. FSFIN § 16‑40‑10 annet ledd. Godkjent prosjekt som ikke oppfyller vilkårene for forsknings- og utviklingsarbeid i FSFIN § 16‑40‑4 kan også få inndratt godkjenningen. Inndragning av godkjenning kan gis virkning for inneværende og tidligere inntektsår.