FIFU-prinsippet gjelder ikke dersom en skattyter eller et mellomliggende selskap realiserer aksjer i et oppstartsselskap i løpet av 3-årsperioden i sktl. § 6‑53 femte ledd første punktum, når skattyter eller det mellomliggende selskapet har gjort aksjeinnskudd som det dels har vært gitt fradrag for etter sktl. § 6‑53, og dels innskudd som det ikke har vært gitt fradrag for. I slike tilfeller anses aksjer med krav til eiertid å være realisert sist, se sktl. § 6‑53 femte ledd annet punktum. Etter utløpet av eiertiden gjelder FIFU-prinsippet på vanlig måte. Se Prop. 130 LS (2016–2017) pkt. 2.3.6 s. 13. Om aksjeinnskudd i oppstartsselskaper, se emnet A-2, pkt. 3.4.14.