Hvis det er samlet underskudd for et regnskapsår i en jurisdiksjon, og justert skatt for jurisdiksjonen er negativ og lavere enn forventet justert skatt (et beløp som tilsvarer 15 % av samlet justert underskudd i jurisdiksjonen), skal det foretas etterberegning av suppleringsskatt for det aktuelle året, jf. suppleringsskatteloven § 4‑1 femte ledd.

Dette kan oppstå for eksempel hvor det er permanente forskjeller mellom regnskapsmessig resultat og skattemessig resultat, eller hvor det er forskjeller mellom ordinære skatteregler i en jurisdiksjon og suppleringsskattereglene (typisk hvor inntekt som inngår i justert resultat anses skattefri etter ordinære regler i jurisdiksjonen).

Etterberegnet suppleringsskatt skal fastsettes til et beløp tilsvarende differansen mellom samlet justert skatt for jurisdiksjonen og forventet justert skatt. Dette innebærer at den etterberegnede suppleringskatten tilsvarer maksimalbeløpet som ellers ville skjermet for skattlegging for suppleringsskatt. Den etterberegnede suppleringsskatten skal fordeles til hver konsernenhet i jurisdiksjonen i samsvar med suppleringsskatteloven § 5‑4 tredje ledd, se pkt. S-22-8.6.

I stedet for å etterberegne suppleringsskatt i det aktuelle regnskapsåret, kan konsernenheten velge å benytte seg av «fremgangsmåte for bruk av overskytende negativ skattekostnad», jf. suppleringsskatteloven § 4‑1 femte ledd tredje punktum. Ved bruk av denne alternative fremgangsmåten, fremføres den «overskytende negativ skattekostnaden» til etterfølgende regnskapsår. Dersom konsernet ikke har justert overskudd i jurisdiksjonen i det året valget ble tatt, skal den overskytende negative skattekostnaden settes til differensen mellom samlet justert skatt og samlet justert underskudd som omtalt ovenfor for etterberegning av suppleringsskatt.

Etter fremgangsmåten for bruk av overskytende negativ skattekostnad skal konsernenhetene i jurisdiksjonen redusere samlet justert skatt i etterfølgende år med «overskytende negative skattekostnad» som ble beregnet det året valget ble tatt, jf. suppleringsskatteloven § 4‑1 femte ledd fjerde punktum. Den overskytende negative skattekostnaden må benyttes til å redusere samlet justert skatt hvert etterfølgende år og fremføres til senere år inntil den er brukt opp. Så lenge beregnet skatt på samlet overskudd i senere år er lavere enn restsaldo på «overskytende negativ skattekostnad» vil effektiv skattesats for det senere året være null og suppleringsskattesatsen blir da 15 %. Det året «overskytende negativ skattekostnad»-saldoen blir oppbrukt, vil det påløpe suppleringsskatt med beregnet suppleringsskattesats for året, (mellom 0 % og 15 %).

Den overskytende negative skattekostnaden beregnes og videreføres på jurisdiksjonsnivå. Dette gjelder også der konsernet ev. avhender en eller flere konsernenheter i den aktuelle jurisdiksjonen i etterfølgende år. Eventuell overskytende negativ skattekostnad fratrekkes da samlet justert skatt for konsernenheter som er en del av konsernet i inneværende regnskapsår. Avhender konsernet alle sine konsernenheter i den aktuelle jurisdiksjon beholdes likevel saldo for «overskytende negativ skattekostnad» av konsernet, og skal benyttes dersom konsernet igjen får konsernenheter i jurisdiksjonen på et senere tidspunkt, jf. suppleringsskatteloven § 4‑1 femte ledd femte punktum.