Når det er avklart at en skatteregel er i strid med EØS-avtalen, vil den nye rettsoppfatningen kunne innebære at skatt­ytere for flere år tilbake har blitt uriktig skattlagt. Hvor slike saker er påklaget eller allerede tatt opp av skattemyndighetene, må den nye rettsoppfatningen legges til grunn ved den nye behandlingen. Er saken ikke allerede tatt opp til behandling, må skatt­yter selv endre egenfastsettingen etter sktfvl. § 9-4, klage på fastsettingen etter sktfvl. kap. 13 eller anmode om endring av fastsettingen etter sktfvl. kap. 12.

EØS-retten gir ikke skatt­yter krav på endring av fastsetting bakover i tid utover det som følger av skatteforvaltningslovens regler, se FIN 30. mars 2006 i Utv. 2006/746 (vedrørende ligningslovens fristbestemmelser og EØS-retten).

Det følger av EØS-regelverket at dersom ESA har fattet vedtak om tilbakeføring av ulovlig støtte, kan skatt­yter måtte tåle tilbakeføring i opptil ti år tilbake i tid.