Skattebetalingsloven § 5‑9 første ledd bokstav c slår fast at fradrag etter skatteloven § 6‑61 for sjøfolk bosatt i Norge skal komme til fradrag i beregningsgrunnlaget for forskuddstrekk. Fradraget skal være 29 prosent begrenset oppad til det beløp departementet fastsetter. I skattebetalingsforskriften § 5‑9‑10 er fradraget i beregningsgrunnlaget i slike tilfeller begrenset til kr 4 200 per måned.

Det særskilte fradraget for sjøfolk skal gis som et inntektsfradrag, og vil bare redusere grunnlaget for skatt av alminnelig inntekt (nettoskatten). Det er derfor fastsatt en lavere prosentsats og maksimalgrense for arbeidsgiverfradraget enn den prosentsats og det maksimalbeløp som gjelder ved skattefastsettingen, jf. skatteloven § 6‑61.